题目

如何在ncbi的genebank下载人来基因组序列?
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genomes/H_sapiens/CHR_01/
上面有三种fasta版本
hs_alt_Hs_Celera_chr1.fa.gz
hs_alt_HuRef_chr1.fa.gz
hs_ref_GRCh37.p2_chr1.fa.gz
应该下哪一个是人类一号染色体的基因序列?
说明文档里面的这么一段话：
Each file is named according to the abbreviation for the species,
whether the assembly is the reference assembly (_ref_) or an alternate
assembly (_alt_), the assembly name, and either the chromosome label
or the scaffold group (unlocalized, unplaced, or alts).
又是什么意思呢?

提问时间：2021-04-30

答案

这三种版本的序列释放的时间不一样,另外,是由不同的组织公布的.GRCh37.p2这个版本的是由Genome Reference Consortium与2010年7月公布的,HuRef这个版本是由 J Craig Venter Institute 于2007年5月公布的,Celera这个版...